A

本题考查经济业务对留存收益的影响。留存收益包括盈余公积和未分配利润；提取盈余公积（包括法定盈余公积和任意盈余公积）不影响企业留存收益总额；将盈余公积用于转增资本会导致留存收益减少，因此，该企业留存收益的年末余额=100+600-40=660（万元），选项A当选；选项B不当选，在计算留存收益总额时，误将计提的法定盈余公积金额扣除；选项C不当选，在计算留存收益总额时，误将计提的任意盈余公积金额扣除；选项D不当选，未考虑将盈余公积转增资本对留存收益总额的影响。该企业应编制的会计分录为：
（1）结转净利润时：
借：本年利润 600
贷：利润分配——未分配利润 600
（2）计提盈余公积时：
借：利润分配——提取法定盈余公积 （600×10%）60
——提取任意盈余公积 （600×5%）30
贷：盈余公积——法定盈余公积 60
——任意盈余公积 30
（3）将盈余公积转增资本时：
借：盈余公积 40
贷：股本/实收资本 40