1）在招标投标过程中的不妥之处和理由如下。
（1）不妥之处：开标时，由招标人检查投标文件的密封情况。
理由：《招标投标法》规定，开标时，由投标人或者其推选的代表检查投标文件的密封情况，也可以由招标人委托的公证机构检查并公证。
（2）不妥之处：评标委员会由招标人确定。
理由：一般招标项目的评标委员会采取随机抽取方式。该项目属一般招标项目。
（3）不妥之处：评标委员会委员共有8人组成，其中招标人代表4人，经济专家2人，技术专家2人。
理由：根据《招标投标法》规定，评标委员会由招标人的代表和有关技术、经济等方面的专家组成，成员人数为5人以上单数，其中，技术经济等方面的专家不得少于成员总数的2/3。
（4）不妥之处：宣读了A、B、C、D、E、F承包商的名称、投标价格、工期和其他主要内容。
理由：E单位在投标截止日期之后送达，招标人应当予以拒收，不应该宣读其投标文件的主要内容。
2）B单位向招标人递交的书面说明有效。根据《招标投标法》的规定，投标人在招标文件要求提交投标文件的截止时间前，可以补充、修改或者撤回已提交的投标文件，补充、修改的内容作为投标文件的组成部分。
3）在开标后，招标人应对C单位的投标书作无效投标文件处理，不得进入评标。因为C单位投标书没有单位公章，而且没有法定代表人印章或签字，不符合招投标法的要求。
4）投标书在下列情况下，可作废标处理：
（1）以他人名义投标、串通他人投标、以行贿手段谋取中标或者以其他弄虚作假方式投标的；
（2）以低于成本报价竞标；
（3）投标人递交两份或多份内容不同的投标文件，或在一份投标文件中对统一招标项目报有两个或多个报价，且未声明哪一个有效的；
（4）投标人名称或组织结构与资格预审时不一致的；
（5）投标文件存在重大偏差的：投标文件载明的招标项目完成期限超过招标文件规定的期限；明显不符合技术规格、技术标准的要求；投标文件载明的货物包装方式、检验标准、方法不符合招标文件要求；投标文件附有招标人不能接受的条件；不符合其他实质性要求。
5）招标人对E单位的投标书作无效标的处理是正确的。因为E单位未能在投标截止时间前送达投标文件。

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