精神分裂症的阳性症状与皮层下边缘系统的DA功能亢进有关，阴性症状与大脑皮质内、尤其是前额叶皮质DA功能相对低下有关。5-HT系统功能亢进或低下与患者的情绪、食欲、睡眠及内分泌功能变化有关。抗精神病药物主要通过阻滞多巴胺能受体的作用，使精神症状得到缓解，同时影响了大脑中枢黑质-纹状体内共存的主要神经元多巴胺，造成胆碱能神经亢进，兴奋性增高，最终导致锥体外系反应的发生。阿尔茨海默病脑部乙酰胆碱含量显著减少。