自身免疫性胃炎产生壁细胞抗体和内因子抗体，导致胃体黏膜萎缩，壁细胞损伤，胃酸分泌减少，内因子减少，从而使维生素B12吸收不良。维生素B可以协助叶酸调节红细胞生成，并有利于铁的吸收，因此引起恶性贫血。根据患者出现贫血、体重减轻等症状，实验室检查血清促胃液素水平增高可诊断为自身免疫性胃炎。其他胃炎如萎缩性胃炎、慢性浅表型胃炎等均不会导致贫血。自身免疫性胃炎以富含壁细胞的胃体黏膜萎缩为主。壁细胞损伤后能作为自免疫系统，而产生相应的壁细胞抗体和内因子抗体，破坏壁细胞，使胃酸分泌减少乃至缺失。自身免疫性胃炎时，壁细胞抗体和内因子抗体呈阳性，胃酸缺乏，血清促胃液素水平明显增高。胃蛋白酶原需在酸性环境下转变为有活性的胃蛋白酶，胃酸缺乏时，胃蛋白酶水平下降。该类疾病最有效的治疗方法是肌注维生素B。