在接受化学神经消融术之前，患者可能已接受过诊断性区域麻醉阻滞术，疼痛有效缓解，并且未出现无法接受的不良反应。然而，患者同样必须被充分告知接受化学神经消融术的风险、受益，以及除了该方案之外，患者可选的其他治疗方案。许多医疗纠纷都是由于该手术的并发症所引起。大多数并发症是由于神经溶解剂扩散至周围解剖结构中所导致的。常见不良反应与定位相关，包括注射侧持续的疼痛、麻木、感觉过敏、系统性低血压、肠道及膀胱失功能、运动无力、传入神经阻滞疼痛以及神经炎。