幽门螺杆菌作为慢性浅表性胃炎最主要的病因，其致病机制为：幽门螺杆菌具有鞭毛，能在胃内穿过黏液层移向胃黏膜，其所分泌的粘附素能使其贴紧上皮细胞，其释放尿素酶分解尿素产生NH3从而保持细菌周围中性环境，幽门螺杆菌的这些特点有利于其在胃黏膜表面定植。幽门螺杆菌通过上述产氨作用分泌空泡毒素A(VacA)等物质而引起细胞损害；其细胞毒素相关基因(cagA)蛋白能引起强烈的炎症反应；其菌体胞壁还可作为抗原诱导免疫反应。这些因素长期存在导致胃黏膜的慢性炎症。