医院感染暴发中流行病学处理的基本步骤，前三步分别为：第一步，证实流行或暴发，对怀疑患有同类感染的病例进行确诊，计算其罹患率，若罹患率显著高于科室或病房历年医院感染一般发病率水平，则证实有流行或暴发。第二步，查找感染源：对感染患者、接触者、可疑传染源、环境、物品、医务人员及陪护人员等进行病原学检查。第三步，查找引起感染的因素：对感染患者及周围人群进行详细流行病学调查。之后还有三步，分别是再制定和组织落实有效的控制措施、分析调查资料、写出调查报告。