副交感神经的主要功能是使瞳孔缩小，心跳减慢，皮肤和内脏血管舒张，小支气管收缩，胃肠蠕动加强，括约肌松弛，唾液分泌增多等。副交感神经和交感神经两者在机能上完全相反，有相互拮抗作用。

　　副交感神经通过迷走神经和盆神经支配胃肠道，到达胃肠的副交感神经纤维都是节前纤维，它们终止于胃肠道壁内的神经元，与内大神经系统的神经元形成突触，副交感神经节后纤维支配腺细胞，上皮细胞和平滑肌细胞，其神经未梢大都释放ACh（乙酰胆碱），对胃肠运动和分泌起兴奋作用。

　　交感神经的节后纤维也可直接支酸胃肠道的平滑肌、血管平滑肌及胃肠道的腺细胞。胃肠交感神经未梢释放去甲肾上腺素，通常对胃肠运动和分泌起抑制性作用。