皮损、脓液等标本用20%KOH涂片后镜检，可见直径为12～15μm的厚壁酵母细胞，细胞内可见脂肪小滴，可疑为杜波组织胞浆菌。痰液标本涂片后先用甲醛固定10min，再用吉姆萨染色镜检，如在巨噬细胞发现卵圆形较小的一端有出芽，可疑为荚膜组织胞浆菌。卡氏肺孢菌通过咳痰或导痰收集病人痰液和纤维支气管镜取材，涂片吉姆萨染色后镜检，可见包囊内的囊内小体，疑为申克孢子丝菌时，取患者脓、痰、血等作涂片或切片，革兰染色或PAS染色在巨噬细胞或中性粒细胞内、外，可见革兰染色阳性或PAS阳性卵圆形或梭形孢子，但极易与组织结构相混淆，白假丝酵母菌检查通过涂片革兰染色镜检可见圆形或卵圆形菌体或孢子及假菌丝。