选项A正确，政府综合财务报告和政府决算报告的编制主体均为各级政府财政部门、各部门、各单位；选项B错误，政府综合财务报告反映的对象为级政府整体财务状况、运行情况和财政中长期可持续性，而政府决算报告反映的对象为一级政府年度预算收支执行情况的结果；选项C正确，政府综合财务报告的编制基础为权责发生制，而政府决算报告的编制基础为收付实现制；选项D错误，政府综合财务报告以财务会计核算生成的数据为准，而政府决算报告以预算会计核算生成的数据为准。故选AC。