根据《气体灭火系统设计规范》（GB50370），3.2.4防护区划分应符合下列规定
1防护区宜以单个封闭空间划分；同一区间的吊顶层和地板下需同时保护时，可合为一个防护区
2用管网灭火系统时，一个防护区的面积不宜大于800m2，且容积不宜大于3600m3
3采用预制灭火系统时，一个防护区的面积不宜大于500m2，且容积不宜大于1600m3
每层1200/800=1.5，取2个，1200×6.5/3600=2.2，取3个。共两层，故C选项正确