茎突综合征主要症状是单侧的咽部异物感、疼痛感，也可以存在反射性的耳痛或头颈部的疼痛，并且在头部转动或做吞咽、说话、发音动作时明显加重。主要是由于茎突周围有丰富的血管和神经组织，当茎突过长或伸向的方位及形态发生异常时，可以导致茎突远端贴近的血管和神经发生激惹现象，从而引起一系列的疼痛或异物感觉。