对禽流感至今尚无特效的防治手段，关键是要控制禽流感在禽类中的传播，因此预防人禽流感一般采取以消灭传染源为主的综合性防制措施。
(一)病例隔离与治疗原则
1．对疑似病例、临床诊断病例和确诊病例应进行隔离治疗。目前虽然没有确凿证据证实禽流感存在人与人之间传播，但对人禽流感患者还是应该早期隔离，对患者排泄物进行消毒，并做好密切接触者的个人防护，对密切接触者进行医学随访，并加强周围环境的消毒，患者隔离应至退热和临床症状消失。
2．对症治疗可应用解热药、止咳祛痰药等。儿童忌用阿司匹林或含阿司匹林以及其他水杨酸制剂的药物，避免引起儿童瑞氏综合征。
3．抗病毒治疗应在发病48小时内试用抗流感病毒药物：主要药物有神经氨酸酶抑制剂(如奥司他韦等)、离子通道M阻滞剂(如金刚烷胺和金刚乙胺等)。
4．中医治疗 ①辨证治疗；②中成药应用。
5．支持治疗和预防并发症 注意休息、多饮水、增加营养，给易于消化的饮食。密切观察，预防并发症。抗菌药物应在明确继发细菌感染时使用。
6．重症患者的治疗 重症患者应当送人ICU病房救治。
(二)针对传播途径的控制措施
1．做好禽类的管理 禽类暴发了高致病性禽流感疫情，立即就地扑杀病禽(疫情发生地3km范围内的禽予以扑杀，5km内强制性免疫)，进行疫源地封锁并彻底消毒，限制发生禽流感地区可能被病毒污染的禽类制品在市场上流通。
2．尽量避免与禽类接触 避免直接接触病禽及其排泄物、分泌物等。经常与活禽密切接触的饲养员、屠宰工人等，必须做好防护工作，及时接种流感疫苗等。
3．加强鸡场的粪便管理 养禽者应加强污染粪便的管理，垫料和粪便可采用掩埋、塑料薄膜覆盖进行堆肥或旋转粉碎等方法处理。
4．加强病死动物的管理 病死动物需经消毒后送卫生处理厂处理或就地深埋，防止可能感染H5N1的动物污染扩散。
5．加强检疫，严防疫情传入 口岸动物检疫机关应随时掌握了解国外和国内其他地区禽流感发生情况。一旦出现禽流感疫情，应立即采取禁运等紧急措施，防止病毒输入或疫情的蔓延、扩散。
(三)对易感人群的控制措施
1．做好个人防护 与感染禽流感的家禽密切接触的工作人员必须按要求做好个人防护，接种流感疫苗，预防性服用抗病毒药物，以降低同时感染人类流感和禽流感的几率，从而减少病毒基因重组的可能性。
进行H5N1分离的实验室应达到P3级标准。所有进入实验室的人员必须严格按要求穿戴好防护设备。
2．疫苗免疫在没有适合人用针对H5N1病毒的禽流感疫苗的情况下，疫区及高危人群中提倡使用现行有效的人用流感疫苗，以防止在人类自身发生人、禽流感病毒混合感染，减少人禽流感基因重组的危险。重点人群为老人、12岁以下的儿童以及患有慢性疾病的患者，另外，从事动物禽流感防疫的人员、禽养殖厂的工作人员及其家属以及接触处理病死禽尸体的人员也应定期接种流感疫苗。
从2004年3月始，世界卫生组织为制造商提供H5N1原型疫苗株。目前有少数厂家已经生产小批量的疫苗应用于临床试验。
3．药物预防 对密切接触者可用金刚烷胺预防性服药，同时，可服用一些中药制剂提高身体抵抗力，从而降低感染各种病毒的可能性。群众性防治应以中草药为主，如用西药(金刚烷胺等)预防应在医务人员指导下使用，防止滥用和引起副作用。
4．增强机体免疫力 加强体育锻炼，充分休息，避免劳累，不吸烟、不酗酒，保持良好的免疫力；在日常生活中，特别是在流感高发季节，应注意多摄入一些富含维生素C等增强免疫力的食物，增强机体对病毒性疾病的抵抗力。
5．健康教育 利用大众媒体广泛宣传禽流感防治的相关知识，提高全民自我保健意识，引导群众养成良好的卫生习惯，保持积极健康的心态。食用禽类食品应彻底煮熟。保持房屋通风、清洁卫生。流行季节，儿童尽量不去空气不流畅、人群聚集的公共场所和流感患者的家中。