心室短轴面对于显示左心室各壁心肌厚度及运动较好，但不适于观察瓣膜、流出道以及心尖部，因此短轴面主要用于电影显示，其中电子束CT为直接进行前门控短轴位扫描，多层螺旋CT则采用后门控容积扫描，然后进行多时相的多平面重组获得心动周期各时相的短轴面图像。常用层面包括升主动脉根部层面、二尖瓣层面、左心室体部层面和左心室膈面。