中国卫生信息系统主要由卫生统计信息系统与医学科技信息系统两大部分组成。卫生统计信息系统在中央一级的管理由卫生部卫生统计信息中心负责；医学科技信息系统最高的管理机构是中国医学科学院医学信息研究所；有关疾病监测、疾病控制、卫生监督监测信息与预防医学科技信息由中国疾病预防控制中心相关信息部门主管。