本题考查公司发行股票的会计处理。公司发行股票时，应编制的会计分录为：
借：银行存款 （6×5000）30000
贷：股本 5000
资本公积——股本溢价 （30000-5000）25000
借：资本公积——股本溢价 900
贷：银行存款 900
综上，该业务对“资本公积——股本溢价”科目的影响金额=25000-900=24100（万元），选项C当选；选项A不当选，误将发行股票的全部价款记入“资本公积——股本溢价”科目；选项B不当选，误按“股本”科目金额作为“资本公积——股本溢价”科目的入账金额；选项D不当选，未将应记入“股本”科目的金额从“资本公积——股本溢价”科目中扣除。