补体激活的旁路激活途径越过 C1、C4 和 C2，直接从 C3 开始激活。在正常情况下，血清中的 C3 可受蛋白水解酶等作用，缓慢而持续地裂解，产生少量的 C3b 。C3b 与激活物（如细菌脂多糖、酵母多糖等）结合后，可进一步激活后续补体成分，引发补体级联反应。而 Clr、C1q 参与经典激活途径的起始阶段，C4、C2 也是经典激活途径中参与形成 C3 转化酶的重要成分。所以补体激活的旁路激活途径的起始分子是 C3 。