激光具有高亮度、单色性好、方向性强等特点，能够提供稳定且高强度的光源，适合用于激发荧光标记的细胞，从而获得准确的检测信号。钨灯、汞灯、紫外灯的光强度、单色性等方面不如激光适合流式细胞仪的检测需求；荧光本身不是光源，它是物质在吸收一定能量后发出的光。所以目前流式细胞仪中常用的光源是激光。