急性肾盂肾炎主要是肾盂和肾间质的炎症，病变主要影响肾小管。肾小管受到炎症刺激后，重吸收功能受损，对正常滤过的小分子蛋白质重吸收减少，从而导致蛋白尿，这种蛋白尿以肾小管性蛋白尿为主。肾小球性蛋白尿主要是由于肾小球滤过功能异常引起；混合性蛋白尿是肾小球和肾小管同时受损导致的；溢出性蛋白尿是血浆中异常蛋白质增多所致；组织性蛋白尿是肾组织病变引起的。