分子量与早期免疫反应：IgM是分子量最大的Ig，不是最小的。由于其五聚体结构，分子量可达到900kD左右。正因为这种结构特点，它在抗原初次进入机体时，能够快速结合抗原，在感染早期发挥重要的免疫防御作用。例如，在机体感染细菌、病毒等病原体的初期，IgM是最早产生的抗体，能够快速识别并结合抗原，激活补体系统，从而清除病原体。
血液含量与半衰期：IgM在血液中的含量不是最高的，IgG在血清中的含量最高。IgM的半衰期相对较短，约为10天左右，而IgG的半衰期较长，可达20-23天。
分泌情况：IgM不能分泌入乳汁，分泌型IgA（sIgA）主要存在于乳汁、唾液、泪液等外分泌液中，在黏膜免疫中发挥重要作用。
补体激活能力：IgM激活补体的能力最强，一个IgM分子结合抗原后即可激活补体经典途径，而IgG需要两个或两个以上的分子结合抗原后才能有效激活补体。