该患者低热、乏力，大小关节疼痛，虽面部无红斑，但有蛋白尿和颗粒管型（提示肾脏受累），血常规白细胞减少，且ANA阳性呈均质型1：1000阳性。系统性红斑狼疮可累及多系统，常见症状包括发热、关节痛、血液系统异常、肾脏病变等，ANA是其重要的筛选指标，多呈均质型阳性，故最可能诊断为系统性红斑狼疮。类风湿性关节炎主要表现为对称性、多关节肿胀、疼痛、畸形，以小关节为主，RF多阳性，该患者无关节畸形，故A项不符；多发性肌炎主要表现为肌肉无力、疼痛，血清肌酶升高，该患者无相关表现，故C项不符；干燥综合征主要表现为口干、眼干等外分泌腺受累症状，该患者无相关症状，故D项不符；硬皮病主要表现为皮肤变硬、雷诺现象等，该患者无相关表现，故E项不符。