该患者有双手指关节肿痛病史，现关节肿痛加重，伴间断发热，双手中指近端指间关节梭形肿胀，双腕压痛，活动受限，有皮下结节，ESR升高，RF高滴度阳性，ANA阴性，符合类风湿关节炎的表现。类风湿关节炎可累及胸膜出现胸腔积液。系统性红斑狼疮多有面部红斑、多系统损害，ANA多阳性，故B项不符；结核性胸膜炎多有低热、盗汗、乏力等结核中毒症状，该患者无相关表现，故C项不符；恶性肿瘤引起的胸腔积液多为血性，且患者无肿瘤相关表现，故D项不符；甲状腺功能减退引起的胸腔积液多伴有甲状腺功能减退的其他表现，如畏寒、乏力、水肿等，该患者无相关表现，故E项不符。