原发性补体缺陷病是由于补体系统中某个或某些补体成分的先天性缺陷引起的疾病。补体系统在机体的抗感染免疫、免疫调节等方面发挥重要作用。A选项：该病发病率低，这是原发性补体缺陷病的特点之一，因为它是一种先天性的罕见病，所以A选项正确。B选项：补体系统参与机体的抗感染免疫，尤其是对细菌的杀伤和清除。当补体缺陷时，机体对细菌的抵抗力下降，容易反复发生细菌感染，所以B选项正确。C选项：补体系统的异常与自身免疫性疾病的发生发展有关，系统性红斑狼疮（SLE）是一种常见的自身免疫性疾病，原发性补体缺陷病患者常伴发SLE，所以C选项正确。D选项：原发性补体缺陷病主要影响机体对细菌等病原体的免疫防御，对病毒感染的影响相对较小，一般不会出现反复病毒感染，所以D选项错误。E选项：补体系统的异常可导致免疫复合物在肾脏沉积，引起炎症反应，常伴发慢性肾炎，所以E选项正确。