细菌基因型的改变是指细菌的遗传物质发生了改变，经质粒的转移而使细菌获得新的耐药性，是细菌获得了新的基因，属于基因型的改变。而金黄色葡萄球菌素的丢失、荚膜的丢失以及细菌形态的改变等可能是表型的改变，不一定涉及基因型的变化；细菌形成L型细菌主要是细胞壁缺陷，一般不涉及基因型改变。