细胞质是细菌新陈代谢的主要场所，其中含有核糖体等结构，核糖体是蛋白质合成的场所，所以细胞质是细菌蛋白质和酶类合成的重要场所。选项A荚膜是某些细菌在细胞壁外包绕的一层黏液性物质，主要功能是保护细菌、抗吞噬等，与蛋白质和酶类合成无关；选项B鞭毛是细菌的运动器官，与蛋白质和酶类合成无关；选项C细胞膜具有物质转运、呼吸等功能，不是蛋白质和酶类合成的主要场所；选项E细胞壁主要起保护细菌、维持细菌形态等作用，与蛋白质和酶类合成无关。