革兰染色的原理是基于细菌细胞壁的结构不同。革兰阳性菌细胞壁较厚，肽聚糖含量丰富，交联度高，在乙醇脱色时，肽聚糖层孔径缩小，通透性降低，结晶紫-碘复合物被保留在细胞内，细菌呈现紫色；而革兰阴性菌细胞壁薄，肽聚糖含量少，且有外膜结构，在乙醇脱色时，外膜脂质溶解，细胞壁通透性增加，结晶紫-碘复合物被洗脱出来，再经复染后呈现红色。所以细菌的革兰染色性不同是由于细胞壁结构的不同，答案选B。细胞核结构、细胞膜结构、核糖体结构及中介体结构的差异并非革兰染色性不同的原因。