A选项：冷冻保存法是将菌种置于低温环境下保存，但可能会因冰晶形成等因素对菌种造成损伤，不是最好的保存方法。B选项：半固体保存法是将菌种接种于半固体培养基中，保存时间相对较短，菌种容易变异，不是最佳保存方法。C选项：冷冻真空干燥法是将菌种在低温下快速冻结，然后在真空条件下使水分升华，使菌种处于干燥、低温、缺氧的状态，可长期保存菌种，且能保持菌种的生物学性状稳定，是目前实验室保存菌种的最好方法，所以该选项正确。D选项：普通琼脂斜面保存法是将菌种接种在琼脂斜面上，在合适温度下培养后，置于4℃冰箱保存，保存时间较短，菌种易变异。E选项：干燥保存法虽然能使细菌处于干燥状态，但单独使用效果不如冷冻真空干燥法，不能很好地长期保持菌种活性。