选项A，消毒灭菌主要是杀灭或清除传播媒介上的病原微生物，可减少感染的传播，但不能从根本上防止多重耐药菌的产生。选项B，隔离预防是将感染源、易感人群等分开，防止病原体传播，但对于已经产生的耐药菌无法阻止其产生。选项C，环境控制是对医院环境进行清洁、消毒等，减少病原体的生存和传播环境，但不是防止多重耐药菌出现的关键。选项D，合理用药是防止多重耐药菌出现的最有效措施。不合理使用抗菌药物会导致细菌耐药性的产生和传播，通过合理使用抗菌药物，如严格掌握用药指征、根据药敏试验选择药物等，可以减少耐药菌的产生。选项E，加强管理是一个宽泛的概念，涵盖了多个方面，但合理用药是针对防止多重耐药菌出现最直接有效的措施。