不适当的抗菌药物治疗：长期或不合理使用抗菌药物，会破坏正常菌群的平衡，抑制或杀灭敏感菌，使耐药菌过度生长繁殖，从而导致菌群失调症，A选项描述正确。患者免疫功能紊乱：当患者免疫功能低下或紊乱时，机体对正常菌群的定植抵抗力下降，容易导致菌群失调，例如艾滋病患者、长期使用免疫抑制剂的患者等，B选项描述正确。垂体功能紊乱：垂体功能主要与内分泌调节相关，与菌群失调症的发生没有直接关系，C选项描述错误。外来菌的侵袭：当有大量外来菌侵入人体，且在体内大量繁殖时，可能会打破原有菌群的平衡，引发菌群失调症，D选项描述正确。医疗措施影响：如外科手术、插管、透析等医疗操作，可能会破坏机体的防御屏障，导致细菌移位和定植，进而引起菌群失调，E选项描述正确。