三分群自动血细胞分析仪的基本原理是电阻抗原理。当细胞通过计数小孔时，会引起小孔内外电阻的变化，产生脉冲信号，脉冲信号的大小与细胞体积成正比，通过对脉冲信号的分析将白细胞分为淋巴细胞、单核细胞和中性粒细胞三个群体。多角度偏振光散射原理用于更先进的血细胞分析仪，可提供更多细胞参数；电阻抗与射频法原理、激光与细胞化学法原理、VCS技术（体积、电导、光散射）都是更复杂和高级的血细胞分析技术，不是三分群自动血细胞分析仪的基本原理。