A选项：仅采集可见的黏液，不能全面反映粪便整体情况，可能遗漏其他有意义的病变信息，该选项不合适。B选项：只采集可见的脓液，同样不能代表整个粪便的情况，不能准确判断肠道病变范围等，该选项不合适。C选项：仅采集可见的血液，不能涵盖粪便中的其他成分，对于全面诊断肠道疾病有局限性，该选项不合适。D选项：含脓血粪便能更全面地反映肠道的病理变化，其中的脓血成分对于诊断肠道感染、炎症等疾病有重要意义，该选项正确。E选项：表层的粪便可能不能准确反映肠道内部的真实情况，因为肠道不同部位的粪便成分可能有差异，该选项不合适。