A 选项细菌检查：脑脊液细菌检查一般采用第 1 管脑脊液，因为第 1 管首先流出，受污染的可能性相对较小，更适合用于细菌培养等细菌学检查 。
B 选项化学检查：化学检查通常使用第 2 管脑脊液，第 2 管相对较为纯净，能更准确地进行各种生化指标的检测，如蛋白质、糖、氯化物等含量的测定。
C 选项免疫检查：免疫检查和化学检查类似，也常使用第 2 管脑脊液，以保证检测结果的准确性。
D 选项显微镜检查：第 3 管脑脊液用于显微镜检查，如细胞计数、细胞分类等。这是因为经过前面两管的采集，第 3 管可以尽量避免穿刺过程中可能带入的组织碎片、血液等对细胞计数和分类的干扰，从而获得更准确的细胞相关信息，所以该选项正确。
E 选项一般性状检查：一般性状检查如颜色、透明度、凝固性等，对标本采集顺序没有严格要求，可对采集的脑脊液整体进行观察。