患者输注肠内营养液后出现腹胀、腹痛，应先暂停输注，观察患者情况。但不需要丢弃剩余肠内营养液，可在调整输注速度、温度等条件合适后，根据患者情况再决定是否继续输注，所以A选项“停止输入，丢弃剩余肠内营养液”错误。遵医嘱给予开塞露（B选项），虽然不是最佳处理方式，但在某些情况下也可用于促进肠道蠕动；鼓励患者下床活动（C选项）有助于胃肠功能恢复；检查肠内营养液的输注速度及温度（D选项），可及时调整以减少不适；顺时针按摩或热敷下腹部（E选项）可缓解腹胀等症状。