乳果糖口服后在结肠被乳酸杆菌等细菌分解为乳酸、醋酸而降低肠道pH值，使肠道细菌产氨减少，同时，酸性环境可减少氨的吸收，并促进血液中的氨渗入肠道排出。肝性脑病的发生与血氨基酸比例失调有关，主要为支链氨基酸含量下降，支链氨基酸可调节芳香族氨基酸平衡，抑制大脑中假性神经递质的形成，从而改善肝性脑病的症状。溴隐亭为一种半合成的麦角生物碱，为多巴胺受体激动药，可激动突触后神经元的多巴胺受体，合成多巴胺和真性递质去甲肾上腺素，竞争性取代假性递质，并可扩张血管，加速脑血流量及脑代谢而恢复神志。门冬氨酸鸟氨酸能够快速激活肝脏解毒功能中的关键酶，从而快速改善肝性脑病的临床症状，显著提高患者神志清醒率并且极大缩短清醒时间。肝脏降解氨的方式有二：门静脉周围肝细胞以通过鸟氨酸循环由氨形成尿素为主；肝静脉周围肝细胞以谷氨酸结合氨形成谷氨酰胺为主。鸟氨酸在门静脉周围肝细胞可促进尿素合成；门冬氨酸在肝静脉周围可促进谷氨酰胺合成。治疗肝性脑病的其他药物还包括：谷氨酸盐，包括谷氨酸钠与谷氨酸钾等，此二者在ATP及镁离子作用下，可与氨结合形成谷氨酸胺和水而排出体外；精氨酸，该药可促进鸟氨酸循环，使氨在形成尿素的过程中被清除，但精氨酸的作用需要依赖于肝脏功能，当严重肝衰竭时，常缺乏鸟氨酸氨基甲酸转移酶和精氨酸酶而不易发挥脱氨作用，故效果较差。氟马西尼、纳洛酮、L多巴胺也可治疗肝性脑病，口服抗生索可抑制产尿素酶的肠道细菌，减少氨的生成，从而治疗肝性脑病。