（一）健康教育 教育公众减少直接接触和暴露于飞沫传播。
（二）保持社会距离 减少居住和工作场所拥挤状况，如兵营、学校等。
（三）免疫预防 按照《扩大国家免疫规划实施方案》，流脑疫苗接种4剂次，儿童6～18月龄接种2剂次A群流脑疫苗，3周岁、6周岁各接种1剂次A+C群流脑疫苗。流脑暴发或流行时，应根据疫情的动态，在省级卫生主管部门的统一部署下，开展儿童和高危人群流脑疫苗的应急接种。
（四）监测 流脑的监测包括对病例的监测与主动搜索，健康带菌者监测，病原学监测，特殊人群监测等，主要包括以下几个方面：
1．医疗机构要尽可能在使用抗生素治疗前采集病人脑脊液、血液、咽拭子标本，及时送实验室检测。有条件的医疗机构应尽快开展流脑病原、血清学诊断和药敏实验。
2．市县级疾病预防控制机构要收集流脑病例的脑脊液或急性期血液标本或脑脊液标本进行病原学检测。要求以县为单位的报告首例病人必须采样，出现流行时病例的标本采集率要达到50%以上。市县级疾病预防控制机构在发现流脑首例病例后应在病例密切接触者预防性服药前采集10～20人咽拭子标本，分离到的菌株要及时送省级疾病预防控制机构鉴定，必要时送国家实验室鉴定。
3．发现首例病例后，对病例所在县（市、区）的医疗机构开展病例搜索，必要时开展社区病例主动搜索。
4．省级疾病预防控制机构每年要开展健康人群中2岁以下幼儿、学龄前与学龄儿童及成人脑膜炎奈瑟菌(Nm)带菌情况和人群免疫水平抽样调查，要求全省在流行区和非流行区分别布点，每年采样100～300名健康人标本，开展咽拭子细菌培养和血液标本的抗体水平检测，并对分离的菌株进一步分型。省级疾病预防控制机构要及时将菌株送中国疾病预防控制中心传染病预防控制所开展进一步实验室分析，中国疾病预防控制中心及时公布病原学和血清学监测结果。
5．当出现以村、居委会或学校或其他集体为单位，7天内发现2例或2例以上流脑病例；或在1个乡镇14天内发现3例或3例以上流脑病例；或在1个县1个月内发现5例或5例以上流脑病例疫情时，还应采取以下措施：
(1)当地疾病预防控制机构要立即开展主动监测和病例搜索工作。主动监测范围、频次和持续时间由当地卫生行政部门确定。各级医疗机构对所发现不明原因的具有突然寒战、高热、全身疼痛、头痛、瘀点、瘀斑等症状的病人，实行"零病例"日报告制度。
(2)发生疫情的学校，应实施晨检制度，监测每位学生的健康状况，尤其要了解缺课学生的健康状况，并做好晨检工作的登记和报告工作。
(3)发生疫情的建筑工地，应设立务工人员进出登记制度，掌握本工地流动人员情况，指定专人负责务工人员健康状况监测。
6．各级疾病预防控制机构要定期开展流脑疫情报告情况检查和督导，及时进行疫情分析和预测、预报。流脑监测的具体内容和方法由中国疾病预防控制中心制定下发。