天然抗原如细菌、病毒、异种血清等，它们的结构复杂，具有多种抗原决定簇。这些抗原决定簇在诱导免疫反应时，大多需要T细胞的参与。例如，病毒抗原进入机体后，其表面抗原蛋白首先被抗原递呈细胞摄取，在细胞内进行加工处理，然后将病毒抗原肽-MHCⅡ类分子复合物递呈给T细胞，T细胞识别后激活并辅助B细胞产生针对病毒的抗体。