化学发光酶免疫分析中常用的两种酶是辣根过氧化物酶和碱性磷酸酶。这两种酶都具有较高的活性和稳定性，且有相应的发光底物可供反应，能够催化底物产生发光信号，用于检测各种抗原或抗体。辣根过氧化物酶催化鲁米诺等底物发光，碱性磷酸酶催化4-甲基伞形酮磷酸盐等底物发光。半乳糖苷酶、过氧化物酶（此处表述不准确，一般化学发光酶免常用的是辣根过氧化物酶明确表述）、葡萄糖氧化酶等不是化学发光酶免疫分析中最常用的两种酶。所以选A。