PCR检测是通过检测细菌的特定基因来快速判定菌种，具有快速、灵敏的特点，能在最短时间内初步判定菌种。不染色暗视野下观察活菌形态、革兰染色镜检只能初步观察细菌的形态特征，难以准确判定菌种；鲎试验主要用于检测内毒素；接种SS培养基是分离肠道致病菌的常用方法，但需要一定的培养时间，不能快速判定菌种。所以选E。