选项A，痢疾志贺菌主要通过消化道传播，一般不是医务人员携带并引起医院感染的主要病原菌。选项B，金黄色葡萄球菌是医务人员携带率最高的病原菌之一，该菌可存在于医务人员的皮肤、鼻腔等部位，容易通过接触传播引起医院感染，该选项正确。选项C，普通变形杆菌虽然也可引起感染，但不是医务人员携带率最高且易引起医院感染的主要病原菌。选项D，白喉棒状杆菌主要通过呼吸道传播，不是医务人员携带并引起医院感染的常见病原菌。选项E，粪肠球菌可引起感染，但在医务人员携带率方面不如金黄色葡萄球菌高。