A选项R质粒（耐药质粒）是携带耐药基因的质粒，它可以通过多种方式在细菌之间传递，使细菌获得耐药性，该选项正确。B选项细菌染色体突变可导致细菌的某些基因发生改变，从而产生耐药性，这是细菌耐药的一种常见机制，该选项正确。C选项转座子是一类可在染色体、质粒或噬菌体之间自行移动的遗传成分，可携带耐药基因，导致细菌耐药，该选项正确。D选项耐药基因可通过接合、转化、转导等方式在细菌之间转移，其中接合是细菌传递耐药基因的重要方式之一，所以“耐药基因极少通过接合转移”的说法错误，该选项错误。E选项质粒编码的耐药通常是多药耐药，因为一个质粒上可以携带多个耐药基因，使细菌对多种抗菌药物产生耐药性，该选项正确。