选项A：消化道良性出血与恶性肿瘤出血都可能出现不同程度的阳性，不能通过阳性程度区别，故A错误。选项B：阳性颜色深浅也不能准确区别消化道良性出血与恶性肿瘤出血，故B错误。选项C：消化道恶性肿瘤出血一般为持续性，而良性出血多为间歇性，所以出现阳性持续的时间是区别消化道良性出血与恶性肿瘤出血的关键，故C正确。选项D：标本采集方法对于区别良性与恶性出血并无关键作用，故D错误。选项E：出现阳性早晚不能作为区别消化道良性出血与恶性肿瘤出血的关键，故E错误。