选项A：成人粪便中细菌以大肠埃希菌、厌氧杆菌和肠球菌为主，这些是肠道的正常菌群，故A正确。选项B：健康婴幼儿粪便中可有酵母菌，属于正常情况，故B正确。选项C：粪便中细菌较多，但约占干重的1/3，而不是一半以上，故C错误。选项D：婴幼儿粪便中细菌主要为双歧杆菌、拟杆菌、葡萄球菌等，这些菌群在婴幼儿肠道中发挥重要作用，故D正确。选项E：当粪便革兰阴性杆菌严重减低，球菌或真菌明显增多时，可破坏肠道正常菌群平衡，导致假膜性肠炎等疾病，故E正确。