消化道症状较为多见，尤其见于2岁以下患儿，常有腹胀、腹泻、呕吐。大便中含有粘液者，可能被误诊为痢疾。如果大批小儿在短时间内出现胃肠炎的症状，在未分离出伤寒杆菌之时，很可能被误认为食物中毒。由于肠道的病理变化轻，因此肠出血和肠穿孔的并发症较少见。呼吸道症状比较突出，并发支气管肺炎为多，约半数以上的患儿有长期咳嗽，两肺可闻及干湿性罗音，大多于发病的1～2周内出现。